阿里巴巴正式注册是在1999年9月，次年一月就获得以日本软银集团为首的几家公司的2000万美元（约合1.6亿人民币）投资。在2001年的年底和2002年年年初，阿里巴巴又以发展战略需要，从日本的一个战略投资者“象征性”地融资500万美元（约合4000万人民币），在2004年2月日本软银集团SoftBank再次投下8200万美元重金（约合6.78亿元人民币），继续渗入阿里巴巴。到2014年，雅虎：占有约 39% 的股份比例。日本软银：占有约 29.3% 的股份比例。阿里巴巴：占有约 31.7% 的股份比例。但是，占据阿里巴巴很大比例的控股资本方雅虎，其实也是日本软银集团旗下控制的公司之一也就是说已占据阿里约30%股权的日本公司软银，又以雅虎的身份占据了另外一部分股权。
马云说阿里巴巴变成了夹心饼干了！马云还说：“话不在于你如何讲，而往往在于别人如何听，更可怕的是别人如何写，如何剪接摘取，理解和传播。”所以，他有次出差美国，和商务部长说事，美国人对马云说，你们阿里巴巴是外资企业吧。
马云承认最早的资金来源都要靠风险投资公司的注资，当时国内没有人看好这个项目，所以无奈马云找到了美国的合伙人，之后公司一步步做大，需要进一步的注资，这时候就会稀释最早的股份，然后日本的软银公司看好这个项目，注资2000多万美元，成为了阿里巴巴最大的股东，同时也成为最具投资眼光的公司。
马云非常聪明的定义了阿里巴巴企业，他说：“我们不是普通的民营企业，也不是国有企业，我们把自己定位为中国的‘国家企业’。就像三星是韩国的国家企业、奔驰是德国的国家企业、谷歌和苹果是美国的国家企业一样，今天的中国需要诞生一批能代表中国的年轻人，代表中国的创新技术、创新能力，代表这个国家对世界的贡献的‘国家企业’。”马云的回答精彩！再次证明马云是民族优秀的爱国企业家！
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